VBM / covariance 분석과정 (분석중)

SPM 이용하여 registration 시도 MATLAB 에 SPM12 설치 ( 경로는 최상위 하나만. sunfolder 는 안하는 것) SPM은 nii 파일만 읽을 수 있음. ( gunzip *.nii.gz –> 이렇게 하면 모든 파일이 nii 로변경됨) 하지만 SPM은 GUI 방식이라 사용이 불편하고 한두개 에러가 나도 다시 처음부터해야 하고, multi…

Network 연구

비슷비슷하지만ants를  이용해서 t1 ( wmparc 파일 말고 original t1 )을 FA 이미지 로 변환시키고 거기서 나온 결과를 wmparc 에 적용하는 것이 좋음. antRegistationSyN.sh -d 3 -f orig_nu.nii.gz -m a01_FA.nii.gz -p f -n 24(cpu 수) -t s -o warp antsApplyTransform -d 3 -i wmparc.nii.gz -r a01_FA.nii.gz…

CNN

parameter 수 개산convolutional layer (3*3*3), feature map 5개 라면(input feature * cnn +1 ) * output feature예: 첫번쩨 convolutional layer 라면 ( 3* 3* 3 +1) * 5= 140두번째 layer 라면 : (5 * 3*3*3 + 1) * 5 = 680 pooliing layer, drop layer는…

Install SGE on ubuntu 18.04

방화벽 확인 통신이 안될때 6444,6445 2. 설치 위 방법으로 repo 추가하고 다운 로드 . sign이 안되어 있어 apt update 안되면 –allow-unauthenticated 또는 –allow-insecure-repositories (다만 preference.d 에서 debian 에서 다운 받는 것만 살리고 나머지는 주석으로 사용 안하는 것으로) apt purge gridengine-*  apt autoremove 로 완전히 지우고 설치 설치는 apt install gridengine-master 그리고 나서 execd 설치 설치시 기존에 돌고 있는 프로세스 확실히 죽이고 설치 설치시 automatically setting 을 선택하도록. ( cell = default, 그리고 master, exec 설치시 master 물어 보는데master가 설치된 컴퓨터 이름 지정) SGE_ROOT 지정 (maser, exec 모두 ) – /var/lib/gridengine  3. 컴퓨터 이름 지정 apt 설치시 컴퓨터 이름은 short form 으로 입력 ( 예; qmaster1.localdomain 이라도 입력은 qmaster1 만) / etc/hosts 는 (m,aster, exec z컴퓨터 모두) – 192.168.124.129…

Install TORQUE on centos 8

– 주의 powertool repo 에 있는 것 정상 작동 안함 (4.1 버전) – compile yum install automake, openssl openssl-devel  github 에서 source download ./autogen.sh ./configure –prefix=/soft/pbs –disable-gcc-warnings –with-scp CXXFLAGS=’-fpermissive’ CPPFLAGS=’-fpermissive’  make sudo make install Configuration of TORQUE (centos 8) 컴퓨터 이름 변경 hostnamectl set-hostname ljspc /etc/hosts –> ljspc 로 변경 /var/spool/torque/server_name 을 ljspc 로 변경 ./torque.setup root 하면 에러 안남 2. 경로 지정 export PATH=/soft/pbs/bin:/soft/pbs/sbin:$PATH export PBS_SERVER_HOME=/var/spool/torque export PBS_HOME=/var/spool/torque export…

Papers

Joong Sun Lee, Joon Ho Ahn, Ji Hong Park, Chul Lee, Chang Yoon Kim. Prescription Patterns of Olanzapine among Manic Inpatients with Bipolar Disorder.  The Korean journal of psychopharmacology  2004; 15(3); 325-332. Joong Sun Lee, Jin Kyung Goh, Seong Yoon Kim. Implicit learning in patients with bipolar…